SwiftTarget：空间多组学整合分析

基于图注意力网络与变分自编码器的多模态整合框架，实现空间转录组与染色质可及性数据的联合嵌入、聚类与跨模态插补

分析参数配置

SWITCH v1.0

空间转录组数据 (.h5ad)

空间染色质/组蛋白修饰数据 (.h5ad)

聚类参数 >>

聚类算法

聚类分辨率

近邻数目

降维方法

下游分析选项 >>

差异表达分析

每簇展示基因数

检验方法

跨模态插补

插补方向

可视化基因名

导出嵌入坐标与聚类标签

分析结果

等待分析

上传数据文件并配置参数后，点击"开始分析"

UMAP 图（按组学类型）

UMAP-omics

蓝色：RNA，橙色：ATAC

UMAP 图（按细胞聚类）

UMAP-cluster

聚类结果

RNA 空间聚类分布

Spatial-RNA

ATAC 空间聚类分布

Spatial-ATAC

FOSCTTM 整合分数

--

分数越低代表跨模态对齐越精准

聚类数目

--

RNA 细胞数

--

ATAC 细胞数

--

近邻数目

--

潜在维度

--

分析耗时

--

请在左侧参数面板中勾选"开启跨模态插补"